由于透析膜由海綿狀交聯聚合物組成，代表膜孔徑的截留分子量（MWCO）是一個間接衡量膜分離性能的參數。準確的說，膜的截留分子量可定義為截留率至為少90%的溶質的分子量。由于溶質的滲透特性取決于分子形狀、水合化程度、離子電荷和極性，我們建議選擇截留分子量是被截留物質的分子量的一半/或是將要透過的物質的***分子量的兩倍。

使用時，一端用橡皮筋或線繩扎緊，也可以使用特制的透析袋夾夾緊，由另一端灌滿水，用手指稍加壓，檢查不漏，方可裝入待透析液，通常要留三分之一至一半的空間，以防透析過程中，透析的小分子量較大時，袋外的水和緩沖液過量進入袋內將袋漲破。含鹽量很高的蛋白質溶液透析過夜時，體積增加50％是正常的。為了加快透析速度，除多次換透析液外，還可使用磁子攪拌。透析的容器要大一些，可以使用大燒杯、大量筒和塑料桶。小量體積溶液的透析，可在袋內放一截兩頭燒園的玻璃棒或兩端封口的玻璃管，以使透析袋沉入液面以下。